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A batalha pela sucessão que perdurou por três gerações de xogunato na era Keichou culminou numa violenta batalha de técnicas ninja entre os clãs Kouga e Iga. Sob uma chuva de pétalas, um homem e uma mulher que juraram viver por seu amor foram novamente separados, uma paixão bela em sua transiência.
Contudo, dizem que por obra de Kyouhachirou, o filho adotado de Hattori Hanzo, essas duas pétalas ganharam vida novamente e deixaram duas lembranças neste mundo. Essas crianças, cada uma com seu próprio destino, são Kouga Hachirou e Iga Hibiki. O primeiro tem os olhos do pai; a segunda, os de sua mãe.
Agora estamos na era Kan’ei, e o mundo está em paz. Agora considerados sem utilidade, ninjas começam a desaparecer nas sombras, e os clãs Kouga e Iga pedem um favor a Hachirou e Hibiki, na esperança de reforçar suas fundações.